Sejarah

Pada periode pengembangan kelembagaan tahun 2001-2010 oleh Prof. Dr. HM. Amin Abdullah terjadi peristiwa penting penting periode ini juga dapat disebut sebagai periode transformasi, karena terjadi perkembangan kelembagaan pendidikan tinggi Islam tertua di tanah air, yaitu Transformasi Institut Agama Islam Negeri (IAIN) Sunan Kalijaga menjadi Universitas Islam Negeri (UIN) Sunan Kalijaga berdasarkan Keputusan Presiden Nomor 50 Tahun 2004 Tanggal 21 Juni 2004. Deklarasi UIN Sunan Kalijaga dilaksanakan pada tanggal 14 Oktober 2004. Periode ini di bawah kepemimpinan Prof. Dr. HM. Amin Abdullah (2001-2005).

Dalam melakukan transformasi ini ada syarat yang harus dipenuhi yaitu harus ada fakultas atau program studi yang bersifat umum. Maka didirikanlah Program Studi Ilmu Komunikasi dalam Fakultas Ilmu Sosial dan Humaniora. Prodi Ilmu Komunikasi ini didirikan oleh  Drs. Abdul Rozak dari fakultas dakwah, Drs. Siantari H, dan M Nazili.

Perubahan Institut menjadi universitas dilakukan untuk mencanangkan sebuah paradigma baru dalam melihat dan melakukan studi terhadap ilmu-ilmu agama dan ilmu-ilmu umum, yaitu paradigma Integrasi interkoneksi. Paradigma ini mensyaratkan adanya upaya untuk mendialogkan secara terbuka dan intensif antara hadlarah an-nas, hadlarah al-ilm, dan hadlarah al-falsafah. Dengan paradigma ini, UIN Sunan Kalijaga semakin menegaskan kepeduliannya terhadap perkembangan masyarakat muslim khususnya dan masyarakat umum pada umumnya. Pemaduan dan pengaitan kedua bidang studi yang sebelumnya dipandang secara dimatral berbeda memungkinkan lahirnya pemahaman Islam yang ramah, demokratis, dan menjadi rahmatan lil 'alamin.